Aplicação de acoplamento molecular para o planejamento racional de fármacos para o tratamento da doença de Alzheimer
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Resumo
A Doença de Alzheimer é uma condição neurodegenerativa que afeta as capacidades cognitivas e comportamentais. Com o aumento da expectativa de vida, o número de casos tende a crescer, tornando-se um desafio global para a saúde mental. Atualmente, a abordagem terapêutica visa retardar a progressão da doença, focando na disfunção do sistema colinérgico mediante inibição da enzima acetilcolinesterase (AChE). Entretanto, outros fatores associados impactam na progressão da doença, como a deposição de placas amilóides provocada pela clivagem realizada pela enzima beta secretase 1 (BACE1) que causam neurotoxicidade. Desta forma a pesquisa de inibidores duais para ambas as enzimas (AChE e BACE1) tem se mostrado promissora, e técnicas de modelagem molecular computacional podem ser utilizadas para identificar compostos bioativos. Diante disso, este projeto teve por objetivo identificar potenciais inibidores com ação dual frente a AChE e BACE1, por meio de métodos in silico de acoplamento molecular. Para tanto, o programa GOLD 3.0 2022 foi avaliado com base na capacidade de reproduzir a orientação espacial de ligantes cristalográficos de ambas as enzimas. A eficácia do programa também foi medida pela capacidade de atribuir melhores pontuações a inibidores conhecidos em comparação com compostos semelhantes a inibidores (decoys). A triagem virtual por acoplamento molecular foi realizada frente a um banco com mais de 230 mil compostos e fez uma avaliação de características de biodisponibilidade, toxicologia, perfil de agregação e disponibilidade comercial, onde identificou 6 compostos promissores, sendo apenas 2 deles disponíveis comercialmente. Suas interações intermoleculares foram identificadas e suas características estruturais foram comparadas com a literatura, onde foram observadas semelhanças nestes aspectos, destacando seu potencial de atividade dual nas enzimas alvo.