O desenvolvimento desse trabalho visou, a elaboração, aplicação e avaliação do modelo de Metodologia Ativa Rotação por Estações (RE), através de uma sequência didática que analisou o uso de RE no ensino de Biologia para a modalidade de Educação de Jovens e Adultos (EJA). O estudo foi aplicado em duas turmas da modalidade EJA do 1º ano do Ensino Médio na escola da rede Estadual El Shadai no Município de Barreiras-BA. Para isso, foi elaborada uma sequência didática distribuída em oito aulas de 50 minutos, sobre o conteúdo de genética com ênfase na abordagem CTSA (Ciência Tecnologia e Sociedade Ambiente) para alimentos transgénicos. O modelo de Rotação por Estação ocorreu em dois espaços diferentes da escola sendo: a sala de aula e a sala de convivência. A rotação foi composta de seis estações, sendo: a Estação Conhecendo e Aprofundando o tema; estação Leitura e Debate; estação Experimento; estação Interativa, a Estação Aula Teórica; e Estação DNA Comestível. A aplicação da RE, trouxe como resultado alunos mais participativos e ativos no processo de aprendizagem, onde os resultados se mostraram significativos quanto à aprendizagem dos alunos e também sobre a prática que foi avaliada como ótima/ excelente. Para analisar a eficácia dessa metodologia, foram aplicados questionários inicial e final com as turmas. De acordo com os resultados obtidos, a RE alcançou os objetivos propostos de conhecer as turmas a partir da observação de aulas juntamente com a professora titular, a produção de uma sequência personalizada; observação e identificação do perfil de práticas pedagógicas adotadas pela professora; aplicar e analisar a eficácia da metodologia rotação por estação junto aos estudantes do Ensino Médio. A partir desse estudo, conclui-se que a metodologia de Rotação por Estações , se mostrou eficaz no ensino Biologia, pois melhorou a percepção dos alunos diante do seu processo de aprendizagem tornando-os ativos e protagonistas do seu conhecimento. Além disso, a RE promove a autonomia dos estudantes se mostrando uma importante aliada no ensino personalizado, contribuindo na compreensão dos alunos em especial, no conteúdo de genética, ampliando suas conexões com a realidade cotidiana.