Graduação

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Navegando Graduação por Orientador "Amorim, Igor Costa de"

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    Prospecção e caracterização in silico de peptídeos do tipo taumatina na Maniçoba (Manihot pseudoglaziovii) para aplicações biotecnológicas
    (UNEB, 2025-07-10) Lima, Gabriel Antunes; Amorim, Igor Costa de; Gonçalves, Luana Pereira; Bezerra Neto, João Pacifico
    A caatinga é um bioma brasileiro que abriga plantas nativas com potencial biotecnológico pouco explorado, incluindo a maniçoba (Manihot pseudoglaziovii Pax & K. Hoffm.), sendo esta frequentemente utilizada como forrageira. As proteínas semelhantes à taumatina (TLPs) são proteínas expressas por plantas em casos de estresse biótico que vêm sendo alvo de interesse biotecnológico por suas funções antimicrobianas. Este trabalho tem o objetivo de prospectar e caracterizar TLPs a partir de dados de sequenciamento da maniçoba. Para identificar as sequências de potenciais TLPs, foi construída uma base de dados contendo sequências de TLPs a partir da base de dados do UNIPROT. Em seguida, o tblastn foi utilizado para obter as sequências codificantes de proteínas similares às da base de dados construída. As fases de leitura aberta foram obtidas a partir da ferramenta getorf. As potenciais TLPs foram caracterizadas por meio de diferentes ferramentas de bioinformática para a identificação de domínios conservados, previsão de peptídeo sinal, localização subcelular, predição da atividade antimicrobiana, predição de toxicidade, análise de propriedades físico-químicas e modelagem tridimensional. Os resultados demonstraram que 30 sequências apresentaram pelo menos 15 cisteínas em sua composição, com 10 delas apresentando oito ligações dissulfeto. Dessas TLPs, todas apresentaram atividade antimicrobiana, 23 proteínas apresentaram natureza ácida e sete natureza básica. Além disso, 13 proteínas foram classificadas como estáveis, oito apresentaram probabilidade de presença de peptídeo sinal do tipo Sec/SPI e 12 TLPs foram classificadas como extracelulares. A busca de domínios conservados revelou que 28 proteínas apresentaram domínios específicos, incluindo taumatina, TLP-PA e THN, duas sequências apresentaram domínio da superfamília GH64-TLP-SF. Em relação à toxicidade, seis TLPs não apresentaram toxicidade. A modelagem tridimensional das TLPs revelou a presença de estruturas características nas TLPs avaliadas. No final, considerando todos os parâmetros, foram identificadas três possíveis TLPs candidatas para uso como antimicrobiano. Dessa maneira, os resultados obtidos reforçam o potencial da maniçoba como fonte de moléculas bioativas com potencial biotecnológico, mas que necessitam de estudos posteriores para a validação de sua atividade